ในบางรายอาจพบมีอาการข้างเคียงจากการรักษาได้ ดังนี้ หูอื้อ ตาลาย วิงเวียนศีรษะ อ่อนเพลีย แน่นหน้าอก แสบร้อนบริเวณหน้าอก สายตาสั้นชั่วคราวได้
ส่วนผู้ที่ป่วยโรคปอด มีอาการบาดเจ็บที่ปอด หรือมีอากาศค้างอยู่นอกถุงลมปอด อาจได้รับอันตรายจากการเปลี่ยนแปลงความดันบรรยากาศได้ อาจทำให้เกิดลมรั่วในปอด จึงควรเอ๊กซเรย์ปอด ก่อนการรักษาด้วย เครื่อง HBOT
ส่วนอาการชักมีอาการเกิดขึ้นได้ แต่โอกาสเกิดน้อยมาก มักพบได้ในกรณีที่ความดันเกินกว่า 3 บรรยากาศ ซึ่งไม่ใช่ระดับความดันบรรยากาศที่ใช้ในการรักษาภาวะต่าง ๆ